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生信媛公众号编辑、生信必修课之软件安装课程作者

徐洲更 发表了文章:

不要轻易相信AnnotationHub的物种注释包

发布时间:2018-08-27 20:40:00 浏览:430 回帖 :0

Bioconductor开发的物种注释包系列集合了一个物种不同来源的注释信息,能够根据基因ID对其进行多种来源的注释,比如说基因的别名,基因的功能等。 ...

脚本

徐洲更 发表了文章:

【R数据科学读书笔记】R语言中的管道操作

发布时间:2018-08-26 22:01:00 浏览:476 回帖 :0

R语言中的管道操作 这是R数据科学的读书笔记之一,《R数据科学》是一本教你如何用R语言进行数据分析的书。即便我使用R语言快2年多了,但是读这本书还是受...

函数

徐洲更 发表了文章:

初步组装的杂合基因组如何去冗余

发布时间:2018-08-24 22:34:00 浏览:927 回帖 :0

redundans的目标是辅助杂合基因组的组装,输入文件可以是组装的contig,测序文库以及额外的参考基因组,最后用于搭建出scaffold级别的纯合...

LOG git 序列 test makefile github

徐洲更 发表了文章:

如何使用GMAP/GSNAP进行转录组序列比对

发布时间:2018-08-24 12:15:00 浏览:895 回帖 :0

GMAP最早用于讲EST/cDNA序列比对到参考基因组上,可以用于基因组结构注释。后来高通量测序时代,又开发了GSNAP支持高通量数据比对,这篇文章主要...

线程 数据库 索引 序列

徐洲更 发表了文章:

R语言中GCC编译的问题(续)

发布时间:2018-08-20 13:53:00 浏览:460 回帖 :0

这篇文章承接R语言中GCC编译的问题,这篇文章主要解决我在Linux系统上安装"expm"出现的问题。 出现的问题 这个问题非常的有趣,因为...

linux string gcc

徐洲更 发表了文章:

DRAGEN: 硬件和软件共同加速的变异检测工具

发布时间:2018-08-16 13:28:00 浏览:793 回帖 :0

DRAGEN 这是一篇工具介绍贴,考虑这个工具是要钱的,那些动不动就说别人忘了初心的用户肯定认为我写的是软文,所以这些人就不要继续往下看了...

算法 服务器 测试 索引 prefix mapping

徐洲更 发表了文章:

LAI: 评估基因组质量一个标准

发布时间:2018-08-15 21:44:00 浏览:506 回帖 :0

基因组组装完成之后,就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中,每个contig都能足够的长,能够有一个完整的基因结构,归纳一下就是3...

git 序列 index

徐洲更 发表了文章:

学习从来都不是一件容易的事

发布时间:2018-08-12 22:00:00 浏览:405 回帖 :0

不知不觉间,我给别人上了好多次课程,有些是线上课程,有些是线下课程,有些是收费的,有些是免费的,如果有什么感悟要说,那就是“学习从来都不是一件容易的事。...

徐洲更 发表了文章:

三年后,我又来到了北京

发布时间:2018-07-27 10:39:00 浏览:453 回帖 :1

我再次来到了北京,距离上次,时间已过去3年 三年前的那个暑假,机缘巧合,我去参加北京植物所开的光合夏令营。当时来回只能报销火车的硬座票,所以我硬生生从发...

服务器 培训

徐洲更 发表了文章:

一文了解Perl语言

发布时间:2018-07-24 16:13:00 浏览:453 回帖 :0

我在公众号发过很多编程语言的学习笔记,但是一直没有发Perl语言的编程教程。我大学的时候,学过一段时间的Perl语言,所以和Perl也有点缘分。这次去北...

编程语言 函数 正则表达式 脚本 编程 数据结构 数据类型 perl 数组

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