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生物信息学研究生

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生物数据库搭建教程①——在Ubuntu14.04上部署LAMP环境

发布时间:2018-10-18 00:17:00 浏览:664 回帖 :0

搭建数据库的第一步就是先把环境搭建好。常用的环境有很多啦,我主要用的就是LAMP环境。 何为LAMP? LAMP = Linux + Apache+ ...

php 服务器 mysql ubuntu Apache 数据库 service

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conda的安装与使用(最新版)

发布时间:2018-10-09 21:10:00 浏览:3581 回帖 :0

有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我ga...

python list

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扁桃体日记1

发布时间:2018-08-27 23:08:00 浏览:571 回帖 :0

以下内容无关生信。是我自己在医院做扁桃体切除手术的过程记录~如果点错了朋友可以点右上角或者按返回键了(。・ω・。)ノ 2018.8.26到医院挂号看...

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用cmscan挖掘ncRNA信息

发布时间:2018-08-01 15:45:00 浏览:545 回帖 :0

0.准备工作: 获取Rfam种子 获取Rfam的claninfo 软件安装 待处理物种的基因组文件 新建一个专门用于处理RNA的文件夹mkdir C...

源码 数据库 ftp 序列 type

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一个用interproscan做基因注释的简易教程

发布时间:2018-08-01 15:10:00 浏览:882 回帖 :0

官网地址: http://www.ebi.ac.uk/interpro/download.html github使用手册地址: https://g...

服务器 数据库 path 序列 xml file github

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lachesis辅助组装流程

发布时间:2018-07-30 10:02:00 浏览:765 回帖 :0

准备工作: 准备数据 参考基因组:Ler-1.allpaths_lg.final.assembly.fasta HiC数据:data_1.fastq...

path 脚本 序列

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HiC软件安装篇之Lachesis

发布时间:2018-07-24 10:15:00 浏览:700 回帖 :0

Lachesis是希腊神话众神之一,负责决定生命之线的长度。但是咱们这个lachesis是2013年发表在nature biotechnology上(h...

path gcc prefix boost makefile github

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植物的Transcription Factor挖掘笔记

发布时间:2018-07-20 23:51:00 浏览:378 回帖 :0

1、了解一下有哪些转录因子 1、在网站http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/中查找已知转录因子有哪些 2、下载已有种子 根据第...

序列 fetch

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SQL基础教程笔记

发布时间:2018-07-18 23:58:00 浏览:420 回帖 :0

致谢 首先非常感谢生信技能树的赠书活动送了我这么棒的一本书~ 活动链接: 【好书分享】数据库必知必会 https://mp.weixin.qq.com...

postgres SQL windows 数据库 Create

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MCScanX使用小记

发布时间:2018-07-13 00:50:00 浏览:773 回帖 :0

一篇不知道拖了多久的笔记……欠下的债早晚还是要还的…… 0.软件下载及安装 官网: http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan...

序列 vim awk

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R语言安装xlsx包时的bug

发布时间:2018-06-29 22:43:00 浏览:1088 回帖 :0

xlsx是用来打开excel文件的包,还是蛮常用的。 安装 install.packages("xlsx") 没啥毛病,过了一会儿装好了 libr...

java bug Registry

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RNA-seq常用命令(无参)

发布时间:2018-04-11 17:29:00 浏览:478 回帖 :0

0.前期准备 先在工作目录下创建以下几个目录: 01.raw_data #用于存放原始数据 02.fastq #用于存...

脚本

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用fastp对转录组数据做QC

发布时间:2018-02-06 15:04:00 浏览:426 回帖 :0

链接 fastp: 极速全能的FASTQ文件自动质控+过滤+校正+预处理软件 github地址 看到介绍的时候是真的心动不已↓↓↓ fastp可以仅仅扫...

算法 c++ 源码 多线程 序列 github

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那些MECAT组装基因组中遇到的坑

发布时间:2018-01-27 09:56:00 浏览:602 回帖 :0

链接 Github地址和文章的链接: https://github.com/xiaochuanle/MECAThttps://www.biorxiv....

服务器 c++ 模块 源码 测试 阿里云服务器 perl

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send anywhere:一个全平台的文件传输神器

发布时间:2018-01-25 17:59:00 浏览:531 回帖 :0

简介: Send Anywhere是个免费的跨平台传输软件,使用不受平台和文件大少的限制,无需注册和登录。 支持的平台: 移动端: 有Android,...

windows WordPress 浏览器 Outlook 插件 chrome

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Fastq-dump:我的日常命令

发布时间:2018-01-12 20:00:00 浏览:355 回帖 :0

原文地址:Fastq-dump: 一个神奇的软件 - by hoptop 感谢我洲更学长~记录一下看完学长的这篇文章之后对于我自己的fastq-dum...

file

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emmet学习笔记

发布时间:2017-12-07 21:27:00 浏览:338 回帖 :0

Emmet是一款编辑器插件,支持多种编辑器支持。在前端开发中,Emmet 使用缩写语法,可以快速编写 HTML、CSS 以及实现其他的功能,极大的提高前...

插件 前端开发 html 开发框架

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阿里云ubuntu14.04下lamp环境搭建の备忘

发布时间:2017-11-08 16:52:00 浏览:449 回帖 :0

以下内容大部分来自于网络上的收集,百度搜lamp能搜到很多文字教程。百度lamp搭建 推荐几个视频教程: 在Ubuntu Server下搭建LAMP环...

云栖社区 mysql ubuntu Apache 配置 安全组 service

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本地服务器の清单

发布时间:2017-11-01 18:39:00 浏览:373 回帖 :0

为了做RNA-seq自己组了一台服务器,本来打算印象笔记里存着就好了后来发现好像有蛮多小伙伴也有这样的需要,那就贴出来给大家参考一下好了。 主板:双...

服务器 线程 淘宝 CPU update

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markdown的初体验

发布时间:2017-10-31 20:59:00 浏览:314 回帖 :0

简书官方教程:献给写作者的 Markdown 新手指南 其实早就对markdown写作有耳闻了,一直偷懒没有静下来学。 总觉得要把所有的时间精力都放在一...

markdown update

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