2015 年,我和华大基因立下一个小目标……

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2015 年,我和华大基因立下一个小目标……

阿里巴巴云原生小助手 2020-01-21 10:05:36 浏览749
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导读:2015 年,阿里云和华大基因立下一个目标:到 2020 年,要在 24 小时完成个人全基因组测序。这在当时是一个几乎被认为不可能的挑战。  而在 2020 年刚开始的第 17 天,我们就实现了这个目标!并且把个人全基因组测序分析做到只需要 15 分钟,不到一顿饭的功夫。

云端实现大规模弹性调度计算

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图 1 - WGS 分析过程示意图

基因计算所面临的挑战不同于常规计算,大数据生信分析平台需要具备 PB 级的数据处理能力:存储与压缩、清理及管理、低成本保存的能力;快速、安全的云端分发共享;基因数据的安全隐私保护、大规模数据挖掘;按需调度和弹性扩容等。

此次方案由华大 DNBSEQ 自主测序仪、BGI Online 混合云架构、阿里云容器服务 ACK/AGS 基因服务以及赛乐基因 GPU 加速算法的深度融合而成。其中,华大基因联合阿里

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