MaxCompute分布式计算如何提升基因大数据处理速率?

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MaxCompute分布式计算如何提升基因大数据处理速率?

云学习小组 2016-10-27 19:06:45 浏览3961
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在2016杭州云栖大会首日,来自华大基因的基因组学数据专家黄树嘉在大数据专场分享了《基于数加MaxCompute的极速全基因组数据分析》,他主要从全基因组测序的背景与原理、传统单机分析流程的挑战、基于MaxCompute的方案三个方面进行了分享,详细介绍了华大基因运用阿里云处理海量的实践。

以下内容根据演讲PPT及现场分享整理。


什么是基因

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基因是生命的基本因素,是人类和其他生物的基础遗传物质。细胞内有染色体,染色体是由一个一个的DNA碱基组成的,这些DNA碱基表现出来的是一个个的字符串。人共有23对染色体,有30亿个碱基对,我们在处理的过程中可以把它看作30亿量级的字符串。一个人拥有这么大的数据量,我们在对其进行解读的时候,为了保证数据的准确性,需要有几十层数据的解读。30亿个碱基对多么重要?一个人生老病死、健康与否的信息都会存储在基

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